Tovarlarni bojxona chegarasi orqali olib o‘tishda va qonunchilikda nazarda tutilgan boshqa hollarda bojxona to‘lovlari to‘lanadi. Bojxona to‘lovlariga:
Bojxona bojlarining stavkalari O‘zbekiston Respublikasi Prezidenti tomonidan, bojxona yig‘imlarining stavkalari esa Vazirlar Mahkamasi tomonidan belgilanadi. Qo‘shilgan qiymat solig‘i va aktsiz solig‘i soliq va bojxona to‘g‘risidagi qonunchilikka muvofiq qo‘llaniladi.
Bojxona to‘lovlarining advalor, xos va aralash stavkalari qo‘llanilishi mumkin. Advalor stavka tovarning bojxona qiymatiga nisbatan foizda, xos stavka tovar birligi uchun belgilangan miqdorda hisoblanadi.
Bojxona to‘lovlarini, odatda, deklarant to‘laydi. Shartnomada nazarda tutilgan bo‘lsa, bojxona brokeri ham to‘lovchi bo‘lishi mumkin.
Bojxona rejimlari talablari buzilgan ayrim hollarda bojxona ombori, erkin ombor yoki boj olinmaydigan savdo do‘koni egasi, tashuvchi, shuningdek xalqaro pochta va kurьerlik jo‘natmalari operatorlari ham to‘lovchi hisoblanishi mumkin. Har qanday manfaatdor shaxs to‘lovchi uchun bojxona to‘lovlarini to‘lashga haqli.
Bojxona yig‘imlari, jumladan, bojxona rasmiylashtiruvi, belgilangan joydan yoki ish vaqtidan tashqari rasmiylashtiruv, tovarni bojxona omborida saqlash, transport vositasini bojxona hamrohligida kuzatib borish, dastlabki qaror qabul qilish va intellektual mulk ob’ektini bojxona reestriga kiritish uchun undiriladi.